商转公贷款业务办理方式分为“顺位抵押”和“先还后贷”两种：
(一)“顺位抵押”方式。
原商贷银行是沈阳公积金中心商转公委贷银行的，可选择“顺位抵押”方式办理商转公贷款业务(目前商转公委贷银行包括：建设银行、工商银行、农业银行、中国银行、交通银行、盛京银行，逐步将其他银行纳入商转公委贷银行范围)。在“顺位抵押”方式下，公积金贷款直接划拨至原商贷银行账户用于提前偿还商业贷款，形成公积金+商业银行组合贷款，借款申请人无需提前结清原商贷余额部分。
(二)“先还后贷”方式。
原商贷银行不是沈阳公积金中心商转公委贷银行的，仅可选择“先还后贷”方式办理商转公贷款业务。在“先还后贷”方式下，经沈阳公积金中心预审通过的职工，须自筹资金先结清原商贷，撤销原商贷房屋抵押登记，而后公积金中心办理商转公贷款房屋抵押登记，贷款资金划拨至借款人个人账户，该方式只能转为纯公积金贷款。
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